奥密克戎强悍来袭,现有的核酸检测是否能防的住?
2022-01-23
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奥密克戎突变的来源



SARS-CoV-2是一种有包膜的单链RNA病毒,其特征是病毒表面有棍棒状突起的刺突蛋白即S蛋白(spike glycoprotein)和异常大的RNA基因组。这个庞大的基因组编码四种主要的结构蛋白:S蛋白、E蛋白(envelope protein)、M蛋白(matrix protein)以及N蛋白 (nucleocapsid protein)。


其中S蛋白位于SARS-CoV-2表面,它负责介导病毒与宿主细胞膜受体的结合和融合。进入宿主细胞后,病毒随即释放基因组RNA、进行RNA复制及蛋白质翻译,并通过内质网和高尔基体的加工完成子代病毒的装配,最后将其释放至胞外[1]

 

奥密克戎于2021年11月9日在南非首次被发现,短短2周时间,该变异株即成为南非豪登省新冠感染病例的绝对优势变异株,增长迅猛。2021年11月26日,WHO将其定义为第五种“关切变异株”(variant of concern, VOC),取名希腊字母Omicron(奥密克戎)变异株[3]。截至1月17日,我国已有14个省份报告了奥密克戎境外输入病例,天津、河南也报告了本土奥密克戎疫情。当前,我国面临着德尔塔与奥密克戎毒株输入疫情的双重挑战。


 


奥密克戎突变的临床意义



目前探讨该变异株传染性、逃逸感染、疫苗诱导免疫、临床表现的新数据,数量有限且多为初步数据,而这些初步数据显示Omicron再感染风险较高、重症风险可能低于其他变异株(再感染是指检测结果阳性后至少90日再次呈阳性)。


一项南非的全国监测数据,发现Omicron变异株再感染与初次感染的比值为0.25,高于Beta和Delta变异株疫情的相应比值(分别为0.12和0.09)。尽管这些数据提示Omicron变异株的再感染风险较高,但分析其他数据后发现,Omicron感染者出现重症的风险可能低于其他变异株感染者[5]



在南非,一家处于这波疫情中心的医院给出了一份非正式报告,在新冠病房的42例患者中,仅33%需要辅助供氧,这低于较早几波疫情初期的辅助供氧比例[6]


根据欧洲疾病与预防控制中心的报告,目前欧盟国家确诊的 Omicron 变异株感染病例均为无症状或轻型,尚未发现 Omicron 变异株死亡病例。博兹瓦纳报告称新增 Omicron 变异株感染病例中,85% 是无症状感染,另外 15% 的感染者症状也相对较轻。



奥密克戎变异株的传播力



全球尚无奥密克戎变异株传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系统研究数据。但2022年1月以来,全球新冠肺炎日新增确诊病例最高已突破350万例,截止2022年1月11日WHO发布的最新周报,在上传到GISAID即全球共享流感数据倡议组织的357206份标本中,其中 Omicron占了58.5%(208870份),Delta占了41.4%(147887份),Alpha,Gamma,Beta占比均小于0.1%[4]。不难看出,奥密克戎传播力强、隐匿性高,正在取代其他变异株。



而奥密克戎与其他变异株,在传染性、单克隆抗体药物的有效性、疫苗保护效果上,也存在一定区别,详见下表。


(点击图片即可放大查看)

 


为什么各国ZF和WHO那么紧张?


    

通过以上分析,我们知道奥密克戎具备以下4个特征:

①传播力极强、隐匿性高,换言之,只要是诊断出1例奥密克戎,就意味着,病例很可能远不止1例;
②再感染率高,远期并发症尚不清楚。也就是说感染人群出现反复感染的几率明显上升,且在症状发作后可能会出现远期呼吸系统并发症;
③当前针对SARS-CoV-2的单克隆抗体,对奥密克戎的中和作用、治疗作用明显下降;
④目前数据表明,新冠疫苗对奥密克戎的保护力减弱。

   

此外,奥密克戎引起的严重病例相对较少,但不是完全没有,最近还发现了一例死亡患者,而且它来得快、被感染得人数基数很大,会在短时间内对医疗系统造成很大冲击,也会影响对重症病人的救治。而这就是为什么奥密克戎不重,而各国ZF和WHO仍然高度重视的原因。


疫苗对奥密克戎到底有没有防御效果,现在仍没有结论,但从流行国的情况来看,没接种疫苗的人会特别容易“中招”,接种了疫苗也有部分会“中招”、但基本没有重症和死亡案例,这说明疫苗还是有一定保护作用。



奥密克戎变异株对

核酸检测试剂的准确性有影响吗?



最近郑州市一起新冠确诊病例引起关注,1例患者在连续7天7次核酸检测后才最终确诊。经多次核酸检测才呈阳性的现象并非孤例。早前,西安、石家庄地区也层出现多次核酸检测才确诊的情况。去年,深圳甚至出现过核酸11次确诊的情况。


 

梳理全国各地公布的确诊病例详细信息,不难发现其中存在大量经多次核酸检测才呈阳性的病例。这一系列的消息不禁让人产生疑问:问题出在什么地方?核酸检测试剂还准确吗?



推测和采样、标本、窗口期有关


  

郑州市疫情防控的工作人员介绍,病毒并非24小时都会出现在咽部,检测结果的准确性会涉及到采样、标本、检验方式等多个环节。


在流行病学专家、复旦大学公共卫生学院教授姜庆五看来,经过多次核酸才确诊不是病毒变异的原因,更大的可能是检验程序上的问题。当事人做检测时病毒可能尚未在检测部位出现。他同时指出,毒性强弱与是否能够被检测是两个概念,只要检测部位客观存在病毒,最终都能被查出来。



中国疾控中心副主任冯子健去年曾在接受采访时也谈及此现象。他给出的解释是:感染者或是病人从暴露感染到病毒开始排毒,专业上叫“强隐期”,而无症状感染者排毒专业上叫做“前隐期”,也可以叫实验室检测筛查的窗口期。在窗口期期间,检测很多次都可能检不到阳性,但到前隐期末就会检出阳性,“这个现象是完全可以理解的。”

 

奥密克戎变异株是否影响

现有的核酸检测试剂?



Omicron变异株的主要突变就是刺突蛋白缺失,可导致一些SARS-CoV-2分子检测无法检出S基因(即编码刺突蛋白的基因)。因而靶向作用于S基因的核酸检测,确实可能产生假阴性的结果。


从理论上来说,如果核酸试剂本身不作用于S基因,那么Omicron的变异对检测试剂的准确性和灵敏度几乎没有影响。例如,上海伯杰新冠核酸检测试剂覆盖新冠病毒的ORF1ab和 N基因保守序列,而非S基因。这也就不难理解,针对Omicron变异株,经过严格的序列比对后,上海伯杰新冠核酸检测试剂不会出现脱靶和漏检,仍可保证检测试剂的准确性和灵敏性。而上海伯杰最新推出的奥密克戎变异株鉴别试剂,仅需一台常规PCR扩增仪,80分钟即可帮助大家快速高效地鉴别Omicron突变株、及时溯源。



当前,我国面临德尔塔和奥密克戎毒株输入疫情的双重挑战。而春运即将开始,人员流动和聚集大幅增加,疫情防控形势也更加严峻,早期核酸检测的重要性更为突出,打好新冠疫情防卫战,伯杰医疗始终在你身边。

   

参考文献

[1]谢艳颖 胡雪.2019 新型冠状病毒( SARS-CoV-2) 的结构和致病机制概述结构和致病机制.生物学教学 2021年( 第 46 卷) 第 4 期

[2]World Health Organization. Tracking SARS-CoV-2 variants. Available at: https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/

[3]吴俣等.新型冠状病毒 Omicron 变异株的流行病学特征及防控研究.中国全科医学,2022年1月,第25卷,第1期

[4]World Health Organization.COVID-19 Weekly Epidemiological Update(2022年1月11日)

[5]Pulliam JRC, et al. Increased risk of SARS-CoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa 2021-12-01. UNPUBLISHED

[6]Tshwane District Omicron Variant Patient Profile-Early Features https://www.samrc.ac.za/news/tshwane-district-omicron-variant-patient-profile-early-features


编辑:小冉  审校:okay